Государственный природный заказник федерального подчинения "Кижский" создан 22 сентября 1989 года Приказом Главохоты РСФСР № 281.

Заказник расположен на островах Онежского озера на юго-востоке полуострова Заонежье, в пределах Медвежьегорского района Республики Карелия.

Целями организации заказника являются: обеспечение охраны диких животных, занесенных в Красную Книгу РФ, в том числе рептилий, амфибий, рыб, моллюсков, насекомых, а также орлана-белохвоста, беркута, сапсана,скопы, малого лебедя; охрана редких и исчезающих видов, а также лекарственных видов растений, среды их произростания (роща карельской березы на Кушнаволоке, заросли древовидных можжевельников); учет и охрана памятников природы, других памятников и исторических достопримечательностей, а также стоянок эпохи мезолита и неолита на островах Б. Клименецкий, Южный и Северный, Оленьи, Кижи.

50 000 га согласно Приложению к Приказу Главохоты № 281 от 22.09.1989 г.

Заказник расположен на землях Заонежского спецсемлесхоза, совхоза "Прогресс" и музея-заповедника "Кижи". Заказник входит в пределы водоохранной зоны Онежского озера.

Между музеем-заповедником "Кижи" и КНЦ РАН заключен договор "О проведении экологического мониторинга по территории музея-заповедника "Кижи".

Музеем-заповедником "Кижи" проводятся лекции по охране природы в населенных пунктах на территории заказника. На территории заказника имеются 3 частные гостиницы на 4-5 человек каждая.