Рельеф заказника представляет слабоволнистую равнину, которая имеет слабый уклон на восток и приподнята над уровнем Каспия примерно на 20 м. В замкнутых понижениях расположены обсыхающие соленые озера – “саги”, из которых наиболее крупное – оз. Колтан-Нур. В северной и северо-восточной частях заказника расположены значительные массивы перевеваемых песков.
Основным рельефообразующим фактором является ветровая эрозия.

Климат сухой, годовое количество осадков составляет около 300 мм. Максимальная температура воздуха в июле достигает +42 ^оС, минимальная - в январе -33 ^оС. Преобладают ветры восточных и западных направлений. Высота снежного покрова достигает 30-35 см, и это наряду с обледенениями оказывает большое влияние на перемещения сайгаков в южном направлении.

Почвы бурые полупустынные разной степени солонцеватости. Гумусовый горизонт имеет мощность 10-15 см. Широко представлен интразональный тип почв - солонцы, приуроченные к замкнутым понижениям рельефа. Подстилающие породы - верхнетретичные и нижнечетвертичные глины мощностью около 500 м.

Гидрологическая сеть как таковая отсутствует.

Растительные сообщества
Господствующее место в заказнике занимают полынно-дерновиннозлаковые степи. В них преобладают два типа сообществ: многолетние ксерофитные злаки (ковыль, овсяница, тонконог, житняк) и полукустарники (полыни, ромашник, эфедра). Лесной фонд представлен кустарниками, окаймляющими берега высохших озер и высаженными для закрепления песков (джузкузган, тамарикс и др.).

Животный мир
На территории Меклетинского заказника взяты под особую охрану журавль-красавка и степной орел, занесенные в Красную книгу СССР. Здесь же проходят пути пролета значительного числа видов птиц, среди которых есть редкие и исчезающие (дрофа и стрепет).

© По материалам Главохоты