Леса заповедника "Шульган-Таш" к моменту его включения в Башкирский заповедник в качестве участка "Прибельский" были расстроены беспорядочными рубками, изрежены, в некоторых местах сильно пострадали от пожаров. Наиболее сохранились леса в бассейне Кужи, труднодоступном для эксплуатации. Долгое время на территории этого участка не проводили никаких лесохозяйственных работ, да и сейчас они ограниченны. Биотехнические мероприятия там связаны с сохранением бортевых пчел.

Заповедник в отношении антропогенного воздействия находится в сравнительно более благоприятной ситуации, чем другие районы Башкирии. Но непрекращающиеся рубки на прилегающих территориях, особенно в водоохранной полосе малых рек, отрицательно влияют на гидрологический режим водотоков заповедника и водно-термический режим почв пограничных участков. Несомненно, воздействует химизация сельского хозяйства окружающих районов. Численность ценнейших рыб - форели, тайменя, хариуса - из года в год сокращается в связи не только с браконьерством, но и с загрязнением близких к заповеднику водоемов, особенно в окрестностях крупных населенных пунктов и животноводческих ферм. Огромное значение имеет нарастающее загрязнение вод Белой молевым лесосплавом, деятельностью Белорецкого металлургического комбината. Эти неблагоприятные факторы отражаются также на численности околоводных и водоплавающих птиц, околоводных млекопитающих.

В естественные экосистемы внесла нарушения и акклиматизация чуждых природному комплексу заповедника видов растений и животных. Некоторые из них (марал, американская норка) сумели приспособиться к здешним условиям, и сейчас их жизнедеятельность существенно отражается на заповедном природном комплексе. Не исключена роль маралов как пищевых конкурентов косули, американская норка практически вытеснила коренной вид - европейскую норку, снизила численность рыб. Особую тревогу вызывает вселение чуждых для Башкирии пород пчел. Это незаметное, но постоянное антропогенное влияние может привести к серьезным последствиям. Изыскание мер по ослаблению этого влияния - одна из важнейших современных задач заповедника.

© Позднякова Э.П., Лоскутов А.В., Скокова Н.Н. 1989
(с изменениями и дополнениями).