Валдай давно привлекал к себе внимание, как уникальный природный комплекс, требующий особой охраны. В 1921 г. "парк-лес" на островах Валдайского озера был объявлен памятником природы. В 1938 г. был создан местный Валдайский заповедник площадью около 5 тыс. га, предложение о создании которого было выдвинуто еще В.П.Семеновым-Тян-Шанским в 1917 г. К сожалению, заповедник был ликвидирован через несколько лет после создания, в годы Великой Отечественной Войны. Тем не менее, территория национального парка многие годы служит базой научных исследований. С 1934 г. здесь Валдайской научно-исследовательской гидрологической лабораторией (ВНИГЛ), принадлежавшей Гидрометеослужбе, систематически проводятся фундаментальные научные исследования в области совершенствования методов изучения режима и закономерностей формирования элементов гидрологического цикла полевых и лесных водосборов, речных и озерных экосистем. Эти исследования во многом явились пионерными для количественного изучения вещественно-энергетического функционирования экосистемного покрова на уровне водосборных бассейнов. В последние годы эти работы осуществляются силами Валдайского филиала Государственного гидрологического института (бывший ВНИГЛ) и Валдайского национального парка. Национальный парк имеет тесные научные контакты с Институтом биологии внутренних вод РАН. Территория Валдая использовалась тремя факультетами МГУ (биологический, почвенный и географический) в качестве полигона при проведении исследований по Международной Биологической Программе. Большой вклад в изучение функционирования экосистемного покрова территории национального парка был сделан в результате непрерывных 15 летних работ Лаборатории биогеографии Института географии РАН и института проблем экологии и эволюции им. А. Н. Северцова РАН. Национальным парком начата долгосрочная программа научно-технического сотрудничества с Новгородским государственным университетом, продолжается сотрудничество с Институтом географии РАН.

В настоящее время научная деятельность парка развивается в области комплексного мониторинга потоков загрязняющих веществ в условиях лесной, луговой и водной экосистем. В г.Валдае находится Экологический центр национального парка, работа которого связана с детским экологическим просвещением. Валдайский национальный парк является членом Федерации Европейских национальных парков, сотрудничает со многими национальными парками России, а также национальными парками "Лахемаа" (Эстония), "Баварский лес" (Германия), "Вануаз" (Франция).

© Справочник "Национальные парки России". Москва: Изд-во Центра охраны дикой природы, 1996 г.