Динамика экосистем юго-восточного Приладожья обусловлена как естественными (главным образом геоморфологическими) процессами, так и прогрессирующим антропогенным изменением природной среды.

Если еще несколько десятилетий назад темпы изменений природных комплексов, вызванные хозяйственной деятельностью, значительно уступали масштабам естественной динамики экосистем Приладожья, то в настоящее время степень антропогенной трансформации природной среды района начинает превышать допустимые пределы.

По мнению ученых, Ладожскому озеру угрожает судьба Великих североамериканских озер. Эвтрофикация озерных бассейнов — процесс естественный, однако при отсутствии антропогенного воздействия — чрезвычайно длительный. Интенсивная хозяйственная деятельность (сельскохозяйственное освоение прибрежных территорий, размещение промышленных объектов) приводит к ускорению этого губительного для озера процесса. Главные источники поступления в Ладогу органического вещества — реки Волхов и Свирь. В этой связи состояние Свирской губы может служить индикатором общей экологической ситуации в бассейне озера.

Следует отметить, что Свирь является составной частью Волго-Балтийской транспортной системы. По ней на протяжении большей части года осуществляется интенсивное судоходство: начинается оно с конца марта и заканчивается к январю. Это в определенной степени влияет на численность и состав водных и околоводных обитателей заповедной зоны.

© Скарлато О.А., Ипатов В.С., Носков Г.А., Боч М.С. Нижнесвирский заповедник. // Заповедники СССР. Заповедники европейской части РСФСР. I. - М., Мысль, 1988. с. 129-151