Рельеф
Территория заказника полностью расположена в пределах Таймырской (Енисейско-Хатангской) низменности и представляет собой плоскую, холмисто-увалистую равнину, расчлененную достаточно густой эрозионной сетью, ледниково-аккумулятивного происхождения с незначительными колебаниями относительных и абсолютных высот. Наиболее возвышенные участки (до 222 м) над уровнем моря расположены в западной части заказника; в основном же абсолютные высоты колеблются в пределах 50-150 м, причемвысоты от 60 до 160 м свойственны водораздельным увалам и возвышенностям, а заболоченные плоские котловины и долины рек располагаются в пределах 20-60 м над уровнем моря.

Климатический режим складывается в основном под влиянием холодных воздушныхмасс, формирующихся над акваторией Северного Ледовитого океана. Высокоширотное положение заказника, продолжительная полярная ночь определяют суровость климата данной территории. Зима здесь продолжительная и морозная, с частыми ветрами и пургами, во время которых скорость ветра достигает 35 м/сек. Среднемесячная температура января (-32,2 °С) при абсолютном минимуме января (-58 °С). Благодаря проникновению теплых воздушных масс из Казахстана и Средней Азии в летний период бывает довольно тепло, среднемесячная температура июля (8,5 °С) при абсолютном максимуме июля (29 °С). Лето короткое и прохладное с большим количеством пасмурных и туманных дней. Июль и август отличаются дождливостью, в это время здесь выпадает почти третьгодовых осадков (общая годовая сумма их порядка 300-350 мм.). Снег может выпасть в течение круглого года. Устойчивый снежный покров держится с октября по июнь. Снежники в летнее время сохраняются нерегулярно, продолжительность безморозного периода не более 60 дней.

Почвенный покров представлен, главным образом, тундрово-дерновыми и тундрово-глеевыми почвами, иногда - торфяно-глеевыми. Мезозойские породы, залегающие в основании Таймырской низменности, почти везде перекрываются суглинистыми ледниковыми осадками и отложениями морской трансгрессии. В районе повсеместно развиты многолетне-мерзлотные породы. Величина сезонно-талого слоя колеблется от 30-40 см в торфах идо 100см в супесчаных и легкосуглинистых почвах водораздельной территории.

Гидрологическая сеть территории заказника хорошо развита. Все реки протекающие здесь принадлежат к водосборному бассейну р. Пура. Река Пура берет свое начало из Пуринских озер и впадает в реку Пясино в ее нижнем течении. Длина р. Пура 376 км и почти на всем своем протяжении она является западной границей заказника. В р. Пура впадает значительное количество больших и малых притоков, обеспечивая ее массой воды. Наиболее крупные из них pеки Моховая и Быстрая впадают в р. Пуру слева и не протекаютпо территории заказника. Крупные правые притоки р. Пуры: Бягой-Бигай, Кысырык, Яптоелота, Ниж. Буотонкага, Лыдика и другие, полностью, от истоков до устья, протекают по территории заказника. На территории заказника находятся большое количество крупных и мелких озер. Наиболее крупные из них: Первое и Второе Пуринские, Сырута, Худыта, Тетедато, Нгадюме и другие, расположены в сравнительно глубоких хорошо выраженных котловинах.По происхождению озера имеют различный генезис. Наиболее многочисленные - термокарстовые. Эти озера имеют самые разнообразные размеры и формы. Крупные озера возникли в результате тектонических опусканий отдельных участков низменности. Старичные озера приурочены к пойменным и первой надпойменной террасам речных долин. Они, как правило, имеют серповидную форму.

Флора территории заказника носит хорошо выраженный арктический характер. Современная арктическая флора сравнительно молодая, ее формирование относят к новейшему геологическому времени. Существенное влияние на развитие современного растительного покрова тундры оказал период послеледникового термального максимума. На территории заказника, относящейся к подзоне типичных северных субарктических тундр, произрастает 240-250 видов сосудистых растений иболее 120 видов лишайников и мхов.

Многие из растений обладают циркумполярным распространением. На ключевом участке -стационаре "Пура", типичном для всей территории заказника, советскими учеными (М.В.Соколовой, 1981 и Г.Е.Вильчеком, 1987) выделено10 типов тундр, и американские ученые (П.Я.Веббер, 1976 и Д.Р.Кляйн, 1977) также выделили10 растительных сообществ.

1. Сухая полигональная разнотравно-кустарниковая и мохово-осоковая с кустарником в понижениях тундра.
2. Пятнистая мохово-осоковая тундра.
3. Мохово-осоково-кустарниковая с сырыми низменными участками тундра.
4. Бугорковатая разнотравно-кустарниковая по береговому склону тундра,
5. Разнотравная по обрывистому берегу реки тундра.
6. Пятнистая мохово-разнотравно-кустарниковая тундра.
7. Разнотравно-кустарниковая тундра.
8. Мохово-осоковая заболоченная тундра.
9. Сырая полигональная низкая тундра.
10. Сухая полигональная тундра.

Фауна заказника типична для Таймырской тундры и представлена следующими видами млекопитающих, птиц и рыб.

Млекопитающие: северный олень, волк, песец, росомаха, горностай, ласка, белый медведь (заходы), бурый медведь (заходы), заяц-беляк, арктическая бурозубка, полевка Миддендорфа, сибирский (обский) лемминг.

Птицы
Хищные: кречет, сапсан, дербник, орлан-белохвост, мохноногий канюк, белая сова, болотная сова.
Куриные: белая куропатка, тундряная куропатка.
Гагары: краснозобая гарага, чернозобая гагара, белоклювая гагара.
Гусеобразные: малый лебедь, гуменник, белолобый гусь, пискулька, краснозобая казарка, шилохвость, чирок свистунок, морская чернеть, гага-гребенушка, морянка, синьга, крохаль длинноносый.
Кулики: тулес, турухтан, бурокрылая ржанка, золотистая ржанка, галстучник, хрустан, фифи, щеголь, круглоносый плавунчик, камнешарка, кулик-воробей, красношейка, белохвостый песочник, краснозобик, дутыш, песчанка, грязовик, азиатский бекас, малый веретенник.
Чайки: серебристая чайка, бургомистр, длиннохвостый поморник, средний поморник, короткохвостый поморник, полярная крачка.
Воробьиные: ворон, черная ворона, серая ворона, рогатый жаворонок, краснозобый конек, белая трясогузка, каменка, варакушка, пеночка-весничка, чечетка, лапландский подорожник, пуночка.

Рыбы
сибирский осетр, кумжа, нельма, сибирская ряпушка, тугун, омуль, пелядь, чир, сиг, муксун, валек, хариус, щука, налим, гольян.

Редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды, встречающиеся на территории заказника "Пуринский":