Территория заповедника почти не подвергалась антропогенному воздействию. По равнинным тундрам издревле небольшими группами кочевали долганы и нганасаны, следы их захоронений можно обнаружить в тундре и в предгорьях. Геологические изыскательские работы, в основном, не затронули территории и кроме старых вездеходных следов серьезных нарушений не оставили. В лесных массивах “Лукунский” и особенно “Ары-Мас” кочующие оленеводы раньше рубили деревья для своих нужд. Сейчас леса восстанавливаются.
Основная территория и Арктический участок удалены от населенных пунктов, их экосистемы находятся практически в первозданном виде. Поэтому Таймырский заповедник - идеальный полигон для изучения естественных природных процессов.
В настоящее время ведутся работы по созданию биосферного полигона заповедника - территории с преобладанием традиционного природопользования коренного населения Таймыра - долган и нганасан. Проектируются территории с оленеводческим и промысловым (охота, рыболовство) направлениями природопользования, расположенные в подзоне южной тундры и в лесотундре.
В 2002 году Администрацией Таймырского АО принято решение о создании национального парка “Попигайский” (зоны традиционного природопользования долган) в бассейне правого притока Хатанги – р.Попигай, предполагается, что управление будет вестись также Таймырским заповедником.
© Е.Б. Поспелова, Ю.М. Карбаинов, А.А. Гаврилов, И.Н. Поспелов, Э.В. Рогачева, Е.Е. Сыроечковский, И.И. Чупин, 1999 г.