Значительная площадь Алтайского заповедника расположена на стыке горных систем Алтая, Саян, Тувы. Сложность естественноисторического развития и физгеографических границ, разнообразие природных условий определяют его исключительное фаунистическое богатство. На заповедной территории можно встретить и обитателей высоких широт (северного оленя, белую куропатку), и жителя монгольских степей (серого сурка), и многих типичных “таежников”. Уникальный зоогеографический интерес Алтая был отмечен в классических трудах академика П. П. Сушкина (1938).

Велико разнообразие беспозвоночных животных заповедника, однако сравнительно полные сведения имеются только о фауне веснянок, стрекоз, поденок и ручейников (Белышев, Дулькейт, 1964; Борисова, 1985; Запекина-Дулькейт, 1977 и др.). Продолжается исследование ряда других групп насекомых.

Из особо редких и заслуживающих охраны насекомых следует отметить единственного представителя своеобразного отряда гриллоблатид в Сибири - галлоизиану Правдина, описанную с территории Алтайского заповедника. Она обитает под камнями и валежинами в хвойно-мелколиственных лесах. Два других вида из этого отряда встречаются в России только на юге Приморского края.

Среди чешуекрылых, включенных в Красную книгу СССР (1984), в заповеднике отмечены обычные здесь аполлон, феб, сенница Геро, а также более редкий махаон. По высокогорьям изредка встречается аполлон Эверсманна, а в Яйлю наблюдали бабочку лента орденская голубая.

Рыбы в заповеднике представлены 16-ю видами. Гольян и голец из семейства вьюновых – обитатели мелководий Телецкого озера и приустьевых участков его притоков. Проходной голец, или мальма, встречается также в верховьях Чулышмана и в некоторых высокогорных озерах. Обычны в Телецком озере щука и окунь, которые держатся в Камгинском и Кыгинском заливах, в озерах и старицах устья Чулышмана. Нерестятся в мае–июне на разливах, откладывая икру на затопленную прошлогоднюю траву. Единственный пресноводный представитель семейства тресковых - налим – предпочитает водоемы с чистой холодной водой. Телецкое озеро можно считать идеальным местом для его обитания. Держится налим у дна, забираясь под коряги и камни. Известны случаи его поимки с глубины более 100 м.

Широколобками или бычками называют на Алтае сибирского и пестроногого подкаменщиков, встречающихся вдоль всего побережья Телецкого озера на небольшой глубине. Эти мелкие рыбки служат пищей налиму, а сами питаются беспозвоночными. Не исключено распространение в Телецком озере радужной форели. Ее выпускали в 1970-х годах в высокогорные озера Восточного Алтая, в том числе в озеро Ежлю-Коль, соединенное с Телецким озером р. Малые Чили.

Наиболее распространенным видом рыб водоемов заповедника следует признать хариуса. Из лососевых характерны таймень, ленок, сиги телецкий и Правдина. Самая крупная рыба заповедника - таймень - живет в Телецком озере. Нерест его проходит ранней весной в нижнем течении Чулышмана. В июне отнерестившиеся рыбы спускаются в озеро вместе с косяками ельца, мигрирующего вдоль заповедного берега вслед за мутной весенней водой реки. Ленок, или, по-местному, ускуч, встречается сравнительно редко в Телецком озере и в нижнем течении его притоков; телецкий сиг, напротив, весьма многочисленный его обитатель. Эндемик Телецкого озера – сиг Правдина – самый мелкий представитель лососевых. Размер его не превышают 13-14 см, а вес едва достигает 20 г. Семейство карповых представлено 4 видами – это елец, лещ, гольян и осман. Особенно интересен осман. Ареал вида невелик, включает в себя Юго-восточный Алтай, Туву, Северо-западную Монголию и Монгольский Гоби. В заповеднике османы встречаются в высокогорных озерах Джулукульской котловины. У этих рыб удлиненное тело с мелкой чешуей; средний вес – 200–300 г., хотя отдельные экземпляры могут достигать длины 60 см и веса 2-2,5 кг. К осени они скапливаются в зимовальных ямах, где в объеме 50-100 л может уместиться до 200 рыб. Расположенные между крупными валунами в прибрежной части водоемов и закрытые сверху торфом и мхом, эти ямы служат надежным убежищем от рыбоядных птиц, главным образом от бакланов.

В ноябре в устье Чулышмана на мелководьях сквозь тонкий, прозрачный лед, как сквозь стекло аквариума, видны большие косяки мелкой рыбешки. Это телецкий елец. Если вспугнуть рыбу, она бросается врассыпную, устремляясь в самые мелкие места, где ей приходится передвигаться между льдом и дном на боку. Точно так же ельцы спасаются от хищных рыб.

Сравнительно недавно появился в Телецком озере лещ, который поднялся сюда по Оби из Новосибирского водохранилища, где его начали акклиматизировать с 1957 г. Сейчас лещ нередок в Камгинском и Кыгинском заливах озера, близ устья Чулышмана.

Современный набор видов местной, довольно богатой для Сибири, герпетофауны отражает историю ее формирования, которое шло на юге Сибири за счет предковой фауны плиоценовых степей и лесной фауны. Разнообразие ландшафтов, обусловленное обширностью заповедной территории, сделало возможным существование здесь сложных фаунистических комплексов. Наиболее интересный в этом плане район – ограничивающая заповедник с запада долина Чулышмана, где старицы обрамлены подобными тугаям зарослями тополя и облепихи, бореальные ельники на северных склонах противостоят петрофитным комплексам на южных, хвойные леса перемежаются мелколиственными, а граница луга и степи определяется порой границей тени от деревьев, растущих по берегу реки.

Долина Чулышмана – единственное место, где встречаются все виды амфибий и рептилий заповедника. Степная гадюка соседствует здесь с обыкновенной; палласова щитомордника можно встретить и среди камней на склонах, и на тропинке в сосняке; узорчатого полоза – практически в любом месте. На южных склонах, где поросшие редкими кустиками караганы степные участки разграничены веерами осыпей, находит себе убежище и пищу прыткая ящерица. Маленькая живородящая ящерица предпочитает более прохладные и влажные моховые ельники по левому борту долины и затененные деревьями заболоченные участки в понижениях. Мелкие водоемы стариц привлекают весной остромордую лягушку, а в самом устье реки, у южной оконечности Телецкого озера, можно встретить серую жабу.

Живородящая ящерица и обыкновенная гадюка встречаются в заповеднике почти повсеместно; остромордая лягушка и обыкновенный щитомордник распространены менее широко, но также придерживаются самых различных биотопов. Места обитания прыткой ящерицы и сибирского углозуба локализованы и приурочены к Прителецкому району и долине Чулышмана.

Обычная в заповеднике остромордая лягушка обладает здесь уникальной особенностью. Нигде на протяжении своего огромного ареала – от Франции до Забайкалья – она не поднимается в горы выше 800 м, тогда как на Алтае нормально чувствует себя на высотах от 400 до 1800 м, а в Алтайском заповеднике проникает за рекордную отметку – 2140 м (Яковлев, 1984).

Прителецким районом ограничено распространение в заповеднике серой жабы, которая вне периода размножения так же малозаметна, как и остромордая лягушка.

Два вида змей – узорчатый полоз и степная гадюка – обитают только в долине Чулышмана. Степная гадюка встречается редко, за все время существования заповедника найдены только четыре экземпляра. Долина Чулышмана – восточная граница ареала этого вида.

В фауне птиц заповедника 311 видов, относящихся к 18 отрядам: воробьиные – 146 видов, кулики и чайки - 45, хищные птицы и совы – 38, гуси и утки – 27 видов. Более 50 видов обитающих в заповеднике птиц занесены в Красную книгу Республики Алтай.

Из гагар в заповеднике гнездится только чернозобая гагара. Отдавая предпочтение крупным безрыбным водоемам (Итыкуль, Сагоныш, Эриколь и др.), чернозобая гагара обитает и по небольшим озерам Джулукульской котловины.

Из поганок в заповеднике наиболее обычна красношейная. Эту миниатюрную птицу можно видеть почти на любом из бесчисленных термокарстовых озер в среднем течении Богояша и у озера Джулукуль, реже в центральных районах - в бассейнах Чульчи и Шавлы. На Телецком озере она встречается только в период весеннего и осеннего пролета вместе с чомгой и черношейной поганкой.

Единственная в заповеднике смешанная колония большого баклана и серебристой чайки находится на двух небольших (50 и 400 м²) островках озера Джулукуль, где среди крупных валунов птицы устраивают свои гнезда в непосредственной близости друг от друга.

Голенастые птицы – выпь, большая белая и серая цапли – встречаются нерегулярно в период сезонных миграций. Иногда в район Телецкого озера залетают колпица, фламинго – редкие птицы, внесенные в Красную книгу России. Не исключена возможность гнездования в заповеднике черного аиста. За последние 15 лет эту редкую птицу наблюдали восемь раз.

На маленьких озерах, во множестве разбросанных по заповеднику, держатся различные утки. Горбоносый турпан, хохлатая чернеть и гоголь обитают на самых бедных в кормовом отношении озерах в лесном и высокогорном поясах; шилохвость, кряква, свиязь, чирки свистунок и трескунок, широконоска, красноголовый нырок предпочитают мелководные, богатые растительными и животными кормами водоемы Джулукульской котловины, среднего течения Чульчи, междуречья Кыги и Сурьязы, а также уединенные заливы Телецкого озера. В самых глухих уголках заповедника изредка можно увидеть выводок гусей-гуменников, но более обычны гуси во время осеннего пролета, когда их гогочущие стаи, уставшие от борьбы с непогодой, опускаются на свинцовую гладь Камгинского или Кыгинского заливов. В это же время на Телецком озере появляются стаи лебедей-кликунов. Этот вид гнездится в заповеднике только в его южной безлесной части, на озерах Джулукульской котловины. В этом же районе обычен огарь. На берегах озер и рек в пределах лесного и лесостепного поясов в дуплистых старых деревьях устраивают свои гнезда большой крохаль и гоголь.

На редко замерзающем Телецком озере кроме регулярно зимующих гоголей (250–300 птиц), больших крохалей и крякв, отмечались чернозобая гагара, красношейная и большая поганки, лебедь-кликун, красноголовый нырок и хохлатая чернеть.
В заповеднике встречаются 28 видов дневных хищных птиц, из них 9 включены в Красную книгу России: беркут, степной орел, бородач, орланы (долгохвост и белохвост), сапсан, балобан, скопа, черный гриф.
Мелкие соколы – обыкновенная и степная пустельги, чеглок, дербник, а также луговой, полевой и степной луни встречаются в самых разнообразных местообитаниях, от участков степи и лесостепи до каменистых тундр высокогорного пояса. В лесной зоне обычны ястребы тетеревятник и перепелятник.
В летний день почти везде можно встретить черного коршуна и обыкновенного канюка. Более редок мохноногий курганник. В заповеднике этот вид встречается только в Джулукульской котловине и на отрогах хребтов Шапшальского, Чулышманского, Чихачёва.

В заповеднике насчитывается 10 видов куриных птиц. Алтайский улар – эндемик Алтае-Саянской горной страны – ранее был занесен в Красную книгу СССР. Обитают улары на открытых каменистых склонах и россыпях в альпийско-тундровом поясе хребтов Чулышманский, Шапшальский, Куркуре и Чихачёва, а также по правобережью Чулышмана между урочищами Улушту и Катуярык. Кеклик и серая куропатка откочевывают в осенне-зимний период на заповедные склоны в долине Чулышмана. На склонах южной экспозиции, обдуваемых ветрами и свободных от снега, птицы кормятся семенами злаков и других травянистых растений. Белая куропатка - птица высокогорий, занятых кустарниковой тундрой. Наиболее многочисленна в южной части заповедника, на Чулышманском плато в районе озера Джулукуль. Тундряная куропатка часто соседствует с белой, но занимает участки сухой каменистой тундры, расположенные выше. Встречается на вершинах Чулышманского, Шапшальского и Абаканского хребтов. Глухарь – типичный обитатель тайги, наиболее обычен в северной части заповедника по хребтам Торот и Абаканскому, в долинах Кокши и Кыги, где расположены основные массивы темнохвойных лесов. В центральных и юго-восточных районах глухарь редок, и его численность на границе лесной зоны в Язулинском лесничестве примерно в пять раз ниже, чем у Телецкого озера. В середине 1930-х годов в прителецкой пихтово-кедровой тайге плотность обитания глухаря достигала 5 птиц на 1 км². В настоящее время на самых крупных токах глухарей, расположенных по хребту Торот, юго-западным склонам массива Корбу и правобережью Чири, одновременно держится от 30 до 50 самцов. Иногда глухари токуют в самых неожиданных местах, например в хозяйственной зоне поселка Яйлю. Рябчик распространен по всей лесной зоне заповедника; численность его меньше в верхних поясах и на юго-востоке, что связано с распространением березы и ольхи. Рябчик достигает наивысшей численности на высоте от 1200 до 1400 м н. у. м. Места обитания тетерева, особенно в гнездовой период, связаны с распространением растительности лесостепного типа (долина Чулышмана) и разреженными лиственнично-березовыми лесами по правобережью Телецкого озера. В зимний период тетеревов неоднократно наблюдали в подгольцовом поясе у г. Колюшта, по правому берегу Кайры и в верховьях р. Верхний Кулаш. С каждым годом все реже и реже можно слышать на Яйлинской и Белинской террасах голос перепела, отмечавшегося еще 40 лет назад Г. Д. Дулькейтом в массовом количестве.

Обширные заболоченные водораздельные пространства в бассейне реки Чульчи служат местом гнездования серого журавля. Возможно, птицы гнездятся и в Джулукульской котловине. В долине Чулышмана заповедные участки невелики по площади, но важны тем, что кроме алтайского улара, здесь гнездится еще один редкий вид – журавль-красавка.

Из пастушковых в заповеднике обычен коростель. Изредка в периоды сезонных миграций на Телецком озере отмечают появление погоныша-крошки, погоныша, пастушка, камышницы и лысухи.
В заповеднике гнездится 10 видов куликов, еще 19 видов изредка встречаются на пролете, а 7 видов отмечены как залетные. В низкогорье обычны бекасы, перевозчики. На берегах таежных озер гнездятся черныши, выше в горах – травники, азиатские бекасы; по заболоченным понижениям – фифи, а по участкам сухих щебнистых тундр – хрустаны.
Речная крачка и серебристая чайка гнездятся небольшими колониями на островках среди крупных и средних озер в Джулукульской котловине. Здесь же изредка встречается черноголовый хохотун, который был занесен в Красную книгу СССР.
Украшение Чулышманской долины – скалистый голубь. Осенью в стаи собирается до 400–600 птиц. Нерегулярно в прителецкой тайге гнездится большая горлица. Малая горлица, сизый голубь и вяхирь отмечены только как залетные виды.

В середине мая, с приходом устойчивого тепла, когда большинство воробьиных птиц приступает к откладке яиц, на приозерных террасах появляется обыкновенная кукушка. Яйца кукушка подкидывает в гнезда горной и маскированной трясогузок, зяблика, лесного конька. Распространена по всей территории и встречается до высоты 2600 м. Голос другого вида – глухой кукушки, очень похожий на голос удода, слышен в начале лета в сырых пихтовых лесах прителецкой части.

В заповеднике гнездится 9 видов сов – филин, бородатая и длиннохвостая неясыти, сплюшка, ушастая, ястребиная и болотная совы, воробьиный и мохноногий сычи. Один вид – белая сова - встречается в отдельные годы в зимний период. Все виды, за исключением болотной совы и сплюшки, очень редки, и их размещение по территории заповедника пока не выяснено.
На Яйлинской и Белинской террасах, а также по долине Чулышмана со второй половины мая слышны долгие однообразные трели козодоя.
Черный и иглохвостый стрижи в заповеднике редки. Бело-поясный стриж – весьма обычная гнездящаяся птица – встречается повсюду, где есть крупнокаменистые осыпи и крутые склоны с выходами скал. В районе Телецкого озера и долине Чульчи встречается регулярно и в значительном числе.
В устьях таежных рек, впадающих в Телецкое озеро, где течение спокойное и высокие берега придают им вид равнинных водоемов и в теплых водах затонов и омутков много молоди хариуса, сига и гольяна, изредка встречается зимородок.

В прителецкой тайге обитает 7 видов дятлов. Желна и трехпалый дятел относительно равномерно представлены во всех лесных массивах – от островков леса на степных склонах долины Чулышмана до разреженных лесов в юго-восточной части заповедника. Большой пестрый, белоспинный и седой дятлы предпочитают березово-сосновые светлые леса на склонах озера. Малый пестрый дятел хорошо заметен в стайках синиц, с которыми он часто кочует в зимние месяцы в поисках корма. Летом его чаще всего увидишь по поймам таежных речек, изобилующим старыми трухлявыми деревьями. Единственный перелетный вид из отряда дятлов – вертишейка - появляется в начале мая и сразу приступает к обследованию дуплянок-синичников, развешанных на территории яблоневого сада в пос. Яйлю.

Далее приводятся сведения о распределении и численности птиц заповедника (включая отряд воробьиных) по вертикальным поясам (Стахеев, 1984 и др.). Среди всех позвоночных животных птицы наиболее ярко характеризуют эту главную особенность природы Алтайского заповедника.

В лесном поясе, занимающем около трети этой территории, отмечено 116 видов гнездящихся птиц. Наиболее богата птицами нижняя часть лесного пояса - светлохвойно-мелколиственные прителецкие леса (106 видов и 630 особей/км²). Здесь доминирует лесной конек, численность которого достигает 65 особей/км². Многочисленны еще 18 видов: чернозобый дрозд; пеночка-теньковка и зяблик (по 50 особей/км²); рябинник (40); обыкновенная чечевица (38); буроголовая гаичка (35); обыкновенная горихвостка (25); черноголовый чекан; пеночка-зарничка и московка (по 22); серая мухоловка; садовая камышевка и певчий дрозд (по 20); большая синица и обыкновенный поползень (по 18); обыкновенная овсянка (12); славка-завирушка и рябчик (по 10 особей/км²).

Среди 22 обычных видов (1–10 особей/км²) наиболее характерны толстоклювая пеночка; серая славка; вьюрок; дрозд-белобровик; деряба; обыкновенный жулан; дубровник; обыкновенный дубонос; вертишейка; обыкновенная иволга. Редких и очень редких видов 67, среди них чаще других встречаются длиннохвостая синица, малая мухоловка, седой дятел, седоголовый и черноголовый щеглы, толстоклювая камышевка.

В пихтово-кедровых прителецких лесах гнездится 79 видов общей численностью 224 особи/км². Здесь общая плотность населения птиц в три раза ниже, чем в светлохвойно-мелколиственных лесах. Доминируют пеночка теньковка (28 особей/км²) и буроголовая гаичка (25). Многочисленны также певчий и чернозобый дрозды, соловей-свистун, синехвостка и синий соловей.

В кедрово-лиственничных лесах Среднечулышманского района гнездятся 67 видов птиц с общей плотностью населения 60 особей/км². Здесь доминируют пеночка-зарничка (50 особей/км²) и пеночка-теньковка (25). Кроме них, многочисленны певчий дрозд и обыкновенная чечевица (по 15). Обычных видов 14; среди них сероголовая гаичка; сибирская мухоловка; синехвостка; обыкновенная пищуха; краснозобый дрозд; сибирская чечевица и др. 49 видов редки и очень редки.

Из видов-индикаторов лесного пояса наиболее характерны глухарь, малый перепелятник, ястребиная сова, бородатая неясыть, мохноногий и воробьиный сычи, глухая кукушка, кукша, кедровка, толстоклювая пеночка, таежная и сибирская мухоловки, соловей-свистун, синий соловей, синехвостка, чернозобый и пестрый дрозды, сероголовая гаичка, сибирская чечевица, щур, обыкновенный клест, овсянка-ремез.

Горная лиственничная лесостепь приурочена в заповеднике главным образом к склонам долины реки Чулышман. Здесь гнездится 83 вида птиц с общей плотностью населения 390 особей/км². Доминируют лесной конек и пеночка-теньковка (75 и 47 особей/км²). Многочисленны еще 9 видов: обыкновенная чечевица, обыкновенная горихвостка, пеночка-зарничка, черноголовый чекан, серая мухоловка, славка-завирушка, садовая и обыкновенная овсянки и полевой жаворонок. Обычных видов 17, из них наиболее характерны степной и полевой коньки, перепел, белошапочная овсянка, удод, коростель, сплюшка, большая горлица, тетерев. Из 45 редких и очень редких видов характерны бородатая куропатка, черный коршун, обыкновенная и степная пустельга, чеглок. К видам-индикаторам авифауны алтайской горной лесостепи В. А. Стахеев относит садовую овсянку и сплюшку.

Горные степи развиты по долинам и склонам вдоль реки Чулышман. Здесь птиц сравнительно немного, гнездится всего 33 вида со средней плотностью 66 особей/км². Доминирует каменка-плешанка - единственный многочисленный вид (24 особи/км²). Обычны скалистый голубь, обыкновенная каменка, перепел, полевой жаворонок, степной конек, обыкновенный козодой, каменка-плясунья, овсянка Годлевского, полевой конек, обыкновенная пустельга, ласточка-воронок, пестрый каменный дрозд. Среди 20 редких и очень редких видов характерны бородатая куропатка, красноухая овсянка, скальная ласточка, журавль-красавка, степная пустельга, рогатый жаворонок, алтайский улар, малый жаворонок и стенолаз.

К видам-индикаторам степного пояса Алтайского заповедника В. А. Стахеев относит кеклика, скалистого голубя, скальную ласточку, малого жаворонка, плешанку и стенолаза.

Субальпийский пояс представлен ерниками, высокотравными лугами, заболоченными моховыми и луговыми участками. Здесь гнездится всего 42 вида птиц. Численность птиц, в зависимости от различий местности, колеблется от 160 до 483 особей/км². В этом отличающемся значительной пестротой ландшафте среди доминирующих видов отмечены пеночка-зарничка, обыкновенная чечевица, горный конек, варакушка, желтоголовая трясогузка. Из видов-индикаторов выделены только два вида: полевой лунь и серый сорокопут. Многие из гнездящихся здесь птиц встречены в альпийско-тундровых и лесных поясах.

Альпийско-тундровой пояс представляет мозаику небольших участков лугов и горных тундр. В целом здесь гнездится тоже 42 вида - как и в субальпийском поясе. Повсеместно доминируют горный конек и хрустан, кое-где – красноспинная горихвостка, тундряная куропатка и сибирский вьюрок. В. А. Стахеев относит к видам-индикаторам 11 видов: тундряная куропатка, хрустан, сибирский вьюрок, мохноногий курганник, клушица, альпийская галка, гималайская и бледная завирушки, индийская пеночка, краснобрюхая горихвостка, жемчужный вьюрок.

На орнитологическом материале хорошо прослеживаются периодические явления в природе Алтайского заповедника. Вслед за Т. Н .Буториной и Е. А. Крутовской (1972), В. А. Стахеевым выделено четыре фенологических фазы весны (Стахеев, 1981).

Первая фаза весны (14 марта – 5 апреля) характеризуется прилетом и пролетом галки, лапландского подорожника, грача, серой вороны, скворца, красноспинной горихвостки, гоголя, кряквы, большого крохаля, дерябы, зяблика, вьюрка, черногорлой завирушки и др.

Вторая фаза (6–26 апреля): начало прилета и пролета черного коршуна, пеночки-теньковки, серого журавля, обыкновенной пустельги, каменки-плешанки, скопы, горного вьюрка, варакушки, лесного конька, певчего дрозда и др.

С 27 апреля по 18 мая – третья фаза весны: начало пролета и прилета синехвостки, черныша, белобровика, черноголового чекана, деревенской ласточки, воронка, чернозобой гагары, большой горлицы, обыкновенной кукушки, славки-завирушки, пестрого дрозда, серой мухоловки и др.

Четвертая фаза весны – 19 мая – 3 июня: начало прилета коростеля, глухой кукушки, иволги, обыкновенного жулана, перепела, садовой камышевки, соловья-красношейки, дубровника и соловья-свистуна.

Последними, в первой фенофазе лета (4–14 июня), прилетают синий соловей, толстоклювая пеночка, толстоклювая камышевка.

Млекопитающие представлены в заповеднике шестью отрядами: насекомоядных – 10 видов, рукокрылых – 7, зайцеобразных – 3, грызунов – 13, хищных – 16 и парнокопытных – 8 видов.

Сибирский крот обитает в долинах и на других участках вплоть до субальпийского пояса. Среди бурозубок наиболее характерны обыкновенная, средняя, малая, тундряная, равнозубая; не представляют особой редкости также бурая и крошечная бурозубки. Водяная кутора и сибирская белозубка относительно редки.

Летучие мыши (ушан, водяная и усатая ночницы, северный кожанок, ночница Иконникова) чаще встречаются в северной половине заповедника, где более мягкий климат и в камнях и скалах достаточно убежищ – небольших пещер и всевозможных расселин. Еще П.Б.Юргенсоном (1938) были отмечены рыжая вечерница и большой трубконос.

Из зайцеобразных на территории заповедника обитают заяц-беляк и два вида пищух (сеноставок) - алтайская и даурская. Зайцы встречаются практически по всему заповеднику, но почти всюду малочисленны. Интересно, что обитают они не только по долинам и в нижнем поясе гор, но и высоко (до 3000 м) в гольцах. Алтайские пищухи очень оживляют горную тайгу и предгольцовые ландшафты своей хлопотливой беготней, пронзительными звонкими свистами. Они заготавливают на зиму сено в очень больших количествах – до центнера в одном стожке (обычно 20–30 кг). При обилии пищух их запасы достигают нескольких тонн на каждый гектар, представляя большую ценность для большинства копытных зверей. Даурские пищухи присущи только степным участкам.

Типичными и наиболее многочисленными обитателями алтайской тайги являются представители отряда грызунов, среди которых по численности преобладают лесные полевки. Помимо таежных видов (красной и красно-серой), здесь встречается и рыжая европейская полевка, а также несколько представителей рода серых полевок (экономка, темная, обыкновенная). По берегам рек и озер нередка водяная полевка, в темнохвойной тайге довольно обычен лесной лемминг, а в гольцовых и горно-луговых участках встречены несколько видов горных полевок - большеухая и плоскочерепная (Новикова, 1971). Среди нескольких видов мышей выделяется как активный потребитель семян кедра азиатская лесная мышь, в открытых биотопах обычна полевая мышь, более редки мышь-малютка, а также лесная мышовка, довольно обычна группа серых полевок (экономка, темная, обыкновенная и узкочерепная). В населенных пунктах отмечены серые крысы и обыкновенный хомяк, единично встречена домовая мышь. Для всей заповедной тайги характерны обыкновенная белка (алтайский подвид) и азиатский бурундук. В Прителецком районе не представляет редкости и летяга. Наиболее крупные представители отряда грызунов – сурки (тарбаган и серый) могут быть встречены только в долине Чулышмана наряду с длиннохвостым сусликом и некоторыми другими обитателями горных степей. Акклиматизированная в Сибири ондатра иногда проникает в северную часть заповедника, в том числе и на Телецкое озеро.

Среди хищных млекопитающих из семейства собачьих в заповеднике обычны волк и лисица. Волки держатся преимущественно в районах, примыкающих к нижней части бассейна Чулышмана, и по восточному берегу Телецкого озера. В малоснежные зимы проникают до окрестностей Яйлю. Зимой они охотятся главным образом на маралов, реже на кабаргу, косуль, в самые последние годы и на кабанов. Летом довольствуются в основном грызунами, птицами и их кладками, другой лесной и луговой мелочью. Также мелкими животными, а зимой иногда падалью или остатками волчьей добычи питаются и лисицы, обитающие преимущественно в южной части заповедника. У южных окраин заповедника можно встретить маленькую степную лисичку - корсака. - Один из обычных, но весьма интересных зверей заповедника – бурый медведь. Следы его деятельности – наброды в высокотравье и поеденные растения дягиля и борщевика, разрушенные муравейники, разрытые норки бурундуков можно встретить почти всюду; лишь в южной безлесной части он редок. Весной, после выхода из берлог, в апреле и почти до конца мая медведи бродят по береговым склонам Телецкого озера и в других местах по солнцепекам, поедая насекомых, первую зелень, остатки маралов, задавленных снежными лавинами или убитых зимой волками. Позже большинство медведей уходит до конца лета в альпийский пояс, где до поздней осени они кормятся свежей зеленью (она все лето появляется на месте растаявших снежников), сочными корнями копеечников.

Довольно много в заповеднике представителей семейства куньих. Среди них и самые мелкие хищники – ласка и горностай, неутомимые истребители мышей и полевок, и такие сравнительно крупные звери, как росомаха, барсук, выдра. Наиболее же известны из куньих как промысловые звери соболь, колонок, солонгой и степной хорь.

Барсук обитает в Прителецком районе и на отдельных участках в бассейне Чулышмана, но численность его в целом невысока. Выдра – большая редкость в заповеднике. Встречается она кое-где по горным таежным речкам с незамерзающими перекатами и полыньями, преимущественно в северной половине заповедника. Немногочисленна в заповеднике росомаха, что связано с особенностями ее биологии. Каждое животное занимает большой индивидуальный охотничий участок, поэтому росомах в тайге не бывает много. Только в трудный малокормный зимний период могут собраться и кормиться около туши погибшего крупного зверя - лося или марала, несколько росомах. Летом они, как и другие хищники, поедают всякую лесную мелочь, питаясь насекомыми, орехами, даже ягодами и растениями; зимой основная их пища – павшие крупные животные, часто остатки волчьей добычи. Только за кабаргой росомаха охотится и довольно успешно. В глубокоснежье или во время наста изредка убивает молодых маралов. Росомаха – зверь для своих размеров очень сильный, ловкий; по характеру она смела, решительна, при необходимости даже агрессивна, держится преимущественно в лесной зоне, но не избегает и высокогорья, где нередко поднимается до пояса горных каменистых и лишайниковых тундр.

Обычным, даже многочисленным для заповедной территории видом является и ценнейший пушной зверек - соболь. Следы его можно встретить почти во всех лесных угодьях и в кустарниковых тундрах до высоты 2400–2500 м. Больше соболя в северной таежной части. В конце 1930-х годов этих зверьков на Алтае истребили почти полностью. Лишь в двух-трех самых отдаленных и труднодоступных уголках, в том числе в верховьях р. Кыги, сохранилось несколько небольших очагов их обитания, в каждом из которых уцелело всего по несколько зверьков. Создание заповедника, запрет охоты на соболя по всему Алтаю и выпуск в регионе нескольких сотен животных, завезенных из других районов страны, позволили быстро восстановить численность вида. Сейчас соболь не только сохраняется на заповедной территории, но и расселяется в соседние угодья, где он стал уже достаточно многочислен.

Обычен на территории заповедника еще один представитель семейства куньих, новосел Алтая – американская норка. Ее выпустили в некоторые урочища в 1930-е годы. Норка успешно акклиматизировалась, обжила все пригодные для нее местообитания, в том числе и на заповедной территории. Сейчас следы ее можно увидеть около большинства горных таежных речек, по берегам Телецкого озера. В годы обилия мелких млекопитающих этот зверек часто встречается и в тайге вдали от водоемов, где также находит себе достаточно пищи и убежищ.

Из семейства кошачьих только рысь встречается более или менее регулярно. Основная ее добыча – зайцы; охотится она также на кабаргу, косулю, иногда за горными козлами в высокогорье. При глубоком снеге может убить молодого марала или лося. Летом часто кормится мелкими грызунами,

Крайне редок в заповеднике снежный барс – ирбис. Этот зверь был занесен в Красные книги СССР и России. Обитает преимущественно высоко в горах, выше границы леса. Главная его добыча - сибирские горные козлы. В заповеднике заходы барса отмечались до южной оконечности Телецкого озера.

Богато представлены в заповеднике копытные звери (Дмитриев, 1938). Самый обычный и один из наиболее многочисленных видов - марал (подвид благородного оленя). Его численность в заповеднике около 2000 животных. В начале 1930-х годов при основании заповедника маралов было гораздо меньше. Даже по восточному берегу озера в самых благоприятных местах обитания они “бродили одиночными особями” – так писал Ф. Шиллингер, обследовавший эти угодья для организации Алтайского заповедника. Общая численность этого вида тогда оценивалась всего в несколько сотен животных.

Также очень мало оставалось к началу 1930-х годов лосей. Всего 150-200 этих животных сохранилось на правобережье Чулышмана, в верховьях р. Чульчи. Сейчас лоси встречаются почти по всей территории заповедника и не только в лесной части, но и в кустарниковых горных тундрах. Сравнительно малочисленна в заповеднике косуля. Держится она в северной части в окрестностях пос. Яйлю и по восточному

берегу Телецкого озера, а также в центральной части в районе среднего течения Чулышмана. Общая численность – несколько сотен животных. Меньше всего косули было в 1960-е годы. Тогда по северным берегам озера она совсем не встречалась. В настоящее время численность растет, и есть надежда, что в недалеком будущем косуля, как и марал, станет одним из обычных в заповеднике видов.

Совсем немного (в пределах нескольких десятков животных) в заповеднике лесных северных оленей. Обитают они по границе с Хакасией и южнее, в верховьях правых притоков Чулышмана.

Повсюду в лесной части, особенно на севере и западе обычна кабарга. Держится она преимущественно в поясе среднегорной тайги на высотах от 500 до 1500 м; ведет скрытный образ жизни. Довольно обычен в заповеднике сибирский горный козел (местное название - бун). Он встречается по правобережью Чулышмана, от устья р. Кайры до южной оконечности Шапшальского хребта. Общая численность около 1000 животных. На самом крайнем юге заповедника по долине р. Богояш и на окружающих хребтах сохраняется до 30-40 алтайских горных баранов (архар или аргали), занесенных в Красную книгу России. По всей вероятности, животные держатся здесь не постоянно, а совершают сезонные кочевки в пределах бассейнов рек Богояш, Башкаус, Колбакая, Буйлюкем.

В начале 1970-х годов на территорию заповедника из Тувы проник кабан. Единичные заходы кабанов на юг Алтая, в том числе и в самую южную часть заповедника, отмечались и раньше, но постоянного обитания вида зарегистрировано не было. В последнее время кабаны здесь освоились, успешно размножаются, численность их постепенно увеличивается. Сейчас они постоянно держатся на восточном берегу Телецкого озера. Есть кабаны и в долинах Кыги, Чульчи и Шавлы, а также в среднем и верхнем течении Чулышмана.

© Н.А. Малешин, Н.А. Золотухин, В.А. Яковлев, Г.Г. Собанский, В.А. Стахеев, Е.Е. Сыроечковский, Э.В. Рогачева, Алтайский заповедник. // Заповедники России. Заповедники Сибири. I, - М., Логата, 1999. с. 58-72