История развития заповедной сети в Хакасии довольно сложна. При организации в 1932 г. Алтайского заповедника в Ойротской автономной области Алтайского края (ныне – Республика Алтай) в его пределы были включены горно-таежные территории верховий реки Большой Абакан (порядка 200 тыс. га – см. “Заповедники Сибири”, т. 1. М., 1999). Во время “реорганизации” заповедной системы СССР в 1951 г.Алтайский заповедник был ликвидирован, а после его восстановления участки Хакасии по Б. Абакану в Алтайский заповедник не вошли (этот вопрос позднее поднимался перед Хакасским облисполкомом, но не получил поддержки).
Заповедание степных участков Хакасии (а также в Туве) впервые было предложено в известном перспективном плане развития географической сети заповедников СССР, разработанным Комиссией по заповедникам Академии наук СССР (Лавренко, Гептнер, Кириков, Формозов, 1958). Более конкретный вариант степного Хакасского заповедника позднее предложили ботаники Центрально-Сибирского ботанического сада (г. Новосибирск). После неоднократных обследований экспедиция под руководством А.В. Куминовой рекомендовала заповедать участок в низкогорном остепненном массиве Саксары (Куминова, 1976 и др.). Этот вариант был отражен в обновленном плане географической сети заповедников РСФСР (Зыков, Нухимовская, 1979) и неоднократно упоминался в рекомендациях различных совещаний по охране природы Сибири (Салатова, 1973 и др.). Он нашел отражение при разработках Генеральной схемы развития сети заповедников Российской Федерации, которые выполнялись в 1978-1979 гг. Центральной научно-исследовательской лабораторией (ЦНИЛ) охотничьего хозяйства и заповедников Главохоты РСФСР (Зыков, Нухимовская, Штильмарк, 1981). В 1981 г. специальная экспедиция Института эволюционной морфологии и экологии АН СССР под общим руководством академика Е.Е. Сыроечковского (нач. отряда – Ф.Р. Штильмарк) провела обследования участков, намечавшихся для создания Хакасского степного (Саксаринского) и Тувинского горно-степного заповедников, но осуществить эти планы не удалось из-за категорических возражений местных руководящих инстанций, которые были в то время крайне озабочены перспективами интенсивного развития овцеводства.
Новый этап проектирования Хакасского степного заповедника начался в 1990 г., когда внимание к хозяйственному освоению степей несколько ослабело, а проблемы охраны природы ставились все более активно. Наибольшую роль в создании проекта сыграли усилия местных специалистов (в частности, С.М. Прокофьева, Ю.И. Кустова, работников областных ведомств лесного и охотничьего хозяйства). Принимали в них участие и сотрудники ЦНИЛ Главохоты РСФСР, а также Института леса и древесины СО АН СССР. К сожалению, первоначальный вариант А.В. Куминовой о создании относительного крупного Саксаринского заповедника (порядка 40 тыс. га) воплотить так и не удалось, поэтому пришлось ограничиться отводом перечисленных семи кластерных территорий общей площадью 24,1 тыс. га (в 1998 г. к участку “Камызякская степь” было присоединено озеро Улух-Холь, площадь увеличилась до 27,7 тыс. га). Степной заповедник в Хакасии, получивший название “Чазы”, был организован постановлением Совета Министров РСФСР в августе 1991 г. Первым его директором, работавшим вплоть до конца 1999 г., был биолог-охотовед С.А. Окаемов, ранее возглавлявший заповедник “Азас” в Тувинской АССР.
Организация ранее самостоятельного горно-таежного заповедника “Малый Абакан”, который был административно объединен с заповедником “Чазы”, была оформлена постановлением Совета Министров РСФСР в сентябре 1993 г. на базе одноименного республиканского заказника, созданного в 1980 г. Его проектирование выполняли в 1979 г. Ф.Р. Штильмарк и Н.Г. Обушенков по заданию Главохоты РСФСР. Первоначально там существовал небольшой местный охотничий заказник (“Тарташский”). Необходимость повышения его статуса и расширения границ была связана с претензиями Абазинского леспромхоза на вырубку особо ценных кедровников по правобережью Малого Абакана. При создании заповедника его границы по сравнению с республиканским заказником несколько изменились (проект был составлен Ю.И. Кустовым, С.М. Прокофьевым и С.А. Окаемовым)
Первоначально заповедники “Чазы” и “Малый Абакан” подчинялись центральным природоохранительным ведомствам Российской Федерации; объединенная их дирекция размещалась в городе Абакане. В ноябре 1999 г. распоряжением Правительства РФ оба заповедника были объединены в один государственный природный заповедник “Хакасский”, переданный в настоящее время из системы упраздненной Госкомэкологии России Министерству природных ресурсов /МПР/.

© Г.В. Девяткин, Ю.И. Кустов, О.О. Липаткина, С.А. Окаемов, С.Н. Прокофьев, Э.В. Рогачева, И.В. Санникова, Е.Е. Сыроечковский, Ф.Р. Штильмарк. Хакасский заповедник. // Заповедники России. Заповедники Сибири. II. - М., Логата, 2000. с. 129-143.