На о-ве Кунашир встречаются представители нескольких флор: японо-корейской, маньчжурской и охотско-камчатской. Из редких видов растений, включенных в «Красную книгу СССР», на территории Курильского заповедника произрастают аралия сердцевидная, башмачки крупноцветковый и настоящий, береза Максимовича, ботрокариум спорный, волчелистник низкий, дубы зубчатый и курчавенький, кандык японский, калопанакс семилопастный, кардиокринум Глена, любка камчатская, магнолия обратнояйцевидная, мирмехис японский, можжевельник Саржента, мятлик шероховатый, орех айлантолистный, падуб морщинистый и Сугероки, пузатка высокая, пыльцеголовник длинно-прицветниковый, рододендрон Чоноски, седлоцветник сахалинский, схизофрагма гортензиевидная, тис остроконечный, чехликоцветник черешчатый, элеорхис японский. Кроме того, значительная часть растений, встречающихся в заповеднике, являются редкими.

Основу растительного покрова слагают леса, под которыми занято более 70% заповедной территории. На темнохвойные леса приходится 60% лесопокрытой площади. Они образованы елями мелкосемянной и Глена, пихтой сахалинской с участием большого количества видов лиственных пород — кленов красивого и желтого, березы ильмолистной и лже-Эрмана, дубов зубчатого и курчавенького, липы Максимовича, бархата сахалинского и калопанакса семилопастного. Более 10% приходится на каменноберезники, и почти 25% — на заросли кедрового стланика. Широколиственные леса из дуба, клена, ильма, бархата и пойменные лиственные насаждения из ив, ольхи и тополя занимают небольшие площади. В лесах встречается большое количество видов деревянистых лиан: виноград Конье, актинидия острая, гортензия черешчатая, краснопузырник щетинковидный, сумах восточный, схизофрагма гортензиевидная. В разреженных древостоях и на лесных полянах буйно разрастается курильский бамбук.

В поймах рек пышно вегетирует высокотравье, достигающее двух-трехметровой высоты. Характерные представители этой травянистой растительности — гречиха (горец) сахалинская, лизихитон камчатский, дудник медвежий, какалия мощная, лабазник камчатский и белокопытник широкий с огромными полутораметровыми листьями.

Высотная поясность растительности хорошо выражена на вулкане Тятя. У подножия вулкана произрастают широколиственные и хвойно-широколиственные леса; темнохвойные леса из ели мелкосемянной и пихты сахалинской отмечены до абсолютной высоты 700 м. Выше располагается прерывистая полоса каменноберезового криволесья, которая сменяется зарослями кедрового стланика, поднимающимися до высоты 1400—1500 м. Среди зарослей кедрового стланика обычны участки верещатников, которые встречаются и выше, до высоты 1600—1650 м. Для верхней части вулкана Тятя характерен комплекс горных тундр и вулканогенной пустыни. Эта высотная поясность и растительные сообщества были сильно нарушены и изменены в результате недавнего извержения вулкана. В заповеднике большой научный интерес будут представлять исследования процессов формирования первичных биоценозов в этом районе активной вулканической деятельности.

© Васильев Н.Г., Шалыбков А.М. Курильский заповедник. // Заповедники СССР. Заповедники Дальнего Востока. - М, Мысль, 1985.