По ботанико-географическому районированию территория парка относится к Среднерусской подпровинции Восточноевропейской провинции Европейской широколиственнолесной области. Она находится в северной части подзоны широколиственных лесов близ границы с хвойно-широколиственными лесами. Леса национального парка являются самым крупным лесным массивом Орловской области.
Флора парка пока еще не изучена полностью. По предварительным оценкам она составляет не менее 700-750 видов.
В зависимости от особенностей рельефа, почвообразующих и подстилающих пород здесь встречаются участки различных лесных сообществ: бореальных сосновых лесов (Pinus sylvestris), ельников из ели европейской (Picea abies), хвойно-широколиственных лесов, широколиственных лесов с доминированием липы (Tilia cordata) и примесью клена платановидного (Acer platanoides), дуба (Quercus robur), ясеня (Fraxinus excelsior) с типичными неморальными элементами. Встречаются небольшие участки березы повислой (Betula pendula), ольшаники из ольхи черной (Alnus glutinosa).
По площади в парке доминируют хвойные леса, среди которых наибольшее распространение имеют сосняки-зеленомошники (Pinus sylvestris). В них могут встречаться типичные таежные виды — брусника (Vaccinium vitis-idaea), вереск (Calluna vulgaris), черника (Vaccinium myrtillus), неморальные — ландыш майский (Convallaria majalis), и лесостепные — прострел раскрытый (Pulsatilla patens) — элементы флоры.
Наиболее интересны еловые леса с типичными бореальными лесными элементами флоры. Уникальны также лиственные леса с доминированием среднеевропейского неморального вида — осоки трясунковидной (Carex brizoides), находящейся на своем северо-восточном пределе распространения.
По лесному массиву левобережья р. Вытебети в понижениях рельефа протянулась полоса участков сфагновых болот (Sphagnum spp.). Это самое южное и юго-восточное распространение заболоченных сфагновых лесов с клюквой мелкоплодной (Oxycoccus microcarpus).
На территории национального парка встречаются крупные лесные луга, где преобладающими являются типичные бореальные виды с широким ареалом, а также болотные и луговоболотные виды. Среди них много редких видов растений.
Флора территории парка включает в себя 130 видов редких и исчезающих растений, некоторые редкие виды имеют здесь границы своих ареалов. Пальцекорник бузинный (Dactylorhiza sambucina) включен в Красную книгу Российской Федерации, а прострел раскрытый (Pulsatilla patens), ирис (Iris sibirica), лилия саранка (Liliuin martagon), лук медвежий (Allium ursinum) относятся к дикорастущим видам флоры, нуждающихся в охране.
В перспективе будут уточнены места произрастания редких и исчезающих видов и оценено состояние уникальных растительных сообществ, охраняемых на территории парка.
© Справочник "Национальные парки России". Москва: Изд-во Центра охраны дикой природы, 1996 г.