Территория национального парка «Лосиный остров» относится к подзоне широколиственно-еловых лесов Валдайско-Онежской подпровинции Североевропейской таежной провинции Евразиатской таежной области.
Несмотря на то, что Московская область считается хорошо изученной во флористическом отношении, полная инвентаризация флоры Лосиного острова до сих пор не проводилась. К настоящему времени на территории парка отмечено 505 видов высших растений. В составс флоры преобладают лесные виды, характерно сравнительно большое число сорных, заносных видов, что связано с местоположением парка в окружении населенных пунктов и наличием вблизи него транспортных магистралей и сельскохозяйственных угодий.
Видов, занесенных в Красную книгу СССР и Красную книгу Российской Федерации, здесь пока ие обнаружено. Однако, в парке довольно широко представлены виды травянистых растений, отнесенные к категории редких и подлежащих охране на территории Москвы и Московской области. В национальном парке доволыю обычен в хвойно-широколиственных лесах волчеягодник обькновенный (Daphne mezereum), не редки ландыш (Convallaria majalis), купальница европейская (Trollius europaeus), колокольчик персиколистный (Campanula persicifolia). В широколиственных лесах отмечены колокольчик крапиволистный (Campanula trachelium), любка зеленоцветковая (Platanthera chlorantha), любка двулистная (P. bifolia), гнездовка настоящая (Neottia nidus-avis). В восточной части парка в хвойных лесах встречаются плаун годичный (Lycopodium annotinum), плаун булавовидный (L. clavatum), гудайера ползучая (Goodyera repens). На Верхне-Яузских болотах, по окраинам сырых ложбин в лесу можно встретить дремлик болотный (Epipaclis palustris), кокушник двурогий (Gynmadenia conopsea), пальцекорники пятнистый (Dactylorhiza maculata), Фукса (D. fuchsii) и мясо-красный (D. incarnata). В национальном парке до сих пор сохраняется небольшая популяция печеночницы благородной (Hepatica nobilis). Это единственное естественное место произрастания печеночницы в ближнем Подмосковье. После восстановления Верхне-Яузского водно-болотного комплекса здесь появились кубышка желтая (Nuphar lutea) и кувшинка белая (Nymphaea alba).
Леса занимают немногим более 80% площади национального парка. На долю хвойных лесов приходится 38%, березняков — 42%, широколиственных лесов — немногим более 16% лесопокрытой площади. В целом леса с доминированием сосны (Pinus sylvestris) занимают 21% лесопокрытой площади, ели (Picea abies) — 15%, лиственницы (Larix sp.) — более 1%, березы (Betula pendula, В. pubescens) — 45%, липы (Tilia cordata) — 12%, дуба (Quercus robur) — около 3%.
Северная и южная части парка различаются по характеру растительности. В северной части — лесные культуры и «ландшафтные» посадки. В южной — целостным массивом сохраняются старые сосновые леса, производные от коренных ельников. Преобладают сосняки с богатым травяным покровом. Древостой состоит из двух подъярусов, в первом доминирует сосна (Pinus sylvestris), но встречается и ель (Picea abies), второй подъярус сложен елью. Негустой подлесок состоит из лещины (Согу-lus avellana). В травяном покрове преобладает кислица (Oxalis acetosella), много ландыша (Convallaria majalis), майника двулистного (Maianlhemum bifolium), папоротников — щи-товника игольчатого (Dryopteris carthusiana) и кочедыжника женского (Athyrium filix-femi-па), встречаются зеленчук желтый (Galeobdo-lon luteum), сныть (Aegopodium podagraria).
В центральной части парка ельники были почти полностью уничтожены и FIX заменили липняки и березняки. Второй ярус сложен почти исключительно широколиственными породами. Основу подлеска составляют лещина (Corylus avellana), жимолость лесная (Loniceга xylosteum), рябина (Sorbus aucuparia), калина (Viburnum opulus), бузина красная (Sambucus racemosa), черемуха (Padus avium), бересклет бородавчатый (Euonymus verrucosa). В травяном покрове доминируют кислица (Oxalis acetosella) и зеленчук (Galeobdolon luteum), им сопутствуют сныть (Aegopodium podagraria), копытень (Asarum europaeum), осока волосистая (Сагех pilosa), ландыш (Convallaria majalis), щитовник мужской (Dryopteris filix-mas).
Липняки (Tilia cordata) в центральной части парка встречаются повсеместно. Старые липняки (140-160 лет) имеют характер парковых насаждений. Подлесок, как правило, в них отсутствует. В травяном покрове в разреженных липняках много чистяка весеннего (Ficaria verna), ветреницы лютичной (Anemonoides ranunculoides), также встречается бор развесистый (Milium effusum), лютик кашубский (Ranunculus cassubicus), пролесник (Mercurialis perennis) и др. виды. Березовые леса, имеющие здесь широкое распространение, не имеют густого подлеска.
В западной части парка сохранились небольшими участками сосновые леса (Pinus sylvestris) с примесью липы (Tilia cordata), дуба (Quercus robur), частично ели (Picea abies). Подлесок средней густоты из лещины (Corylus avellana) с примесью бересклета бородавчатого (Euonymus verrucosa), жимолости лесной (Loniccra xylosteum), рябины (Sorbus aucuparia), крушины (Frangula alnus). В травяном покрове преобладают неморальные виды.
В восточнои части парка распространены сосняки и ельники бореального типа, релсе встречаются березняки с примесью ели и сосны.
Исключительно интересный объект парка — Алексеевская роща, на территории которой длительное время сохранялся заповедный режим. Это уникальный участок леса почти 250-летнего возраста, основной лесообразующей породой которого является сосна (Pinus sylvestris).
© Справочник "Национальные парки России". Москва: Изд-во Центра охраны дикой природы, 1996 г.